La trayectoria del ‘Chueco’ se contabiliza en títulos en el fútbol peruano y Cristal no podía estar fuera de esta cuenta. Tras dirigir a Sport Boys, Defensor Lima, Universitario y Defensor Arica, Marcos Calderón llegó al Rímac en 1972.
Se mantuvo tres años y celebró el campeonato de 1972 luego de clasificar como sexto al grupo que definía el título. Luego no tuvo la misma fortuna y en 1975 pasó a dirigir a la selección peruana, con la que logró el título de la Copa América de ese año.
Sin embargo, Calderón regresó a Cristal tras clasificar y dirigir el Mundial de Argentina 1978. Se puso la celeste entre 1979 y 1981, temporadas en la que levantó el bicampeonato 79-80.
| Año | Puesto en el Descentralizado | Copa Libertadores |
| 1972 | Campeón | No compitió |
| 1973 | Segundo | Tercero del grupo |
| 1974 | Séptimo | Cuarto del grupo |
| 1979 | Campeón | No compitió |
| 1980 | Campeón | Tercero del grupo |
| 1981 | Noveno | Segundo del grupo |
Marcos es el técnico peruano más exitoso de la historia nacional con 10 títulos locales (2 con Boys, 4 con Universitario, 3 con Cristal y uno con Alianza Lima). Lamentablemente, perdió la vida en el la tragedia aliancista del fokker que enlutó a todos en 1987.
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